31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0191 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0191  ferredoxin  100 
 
 
122 aa  245  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000967287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0340  ferredoxin  55.46 
 
 
117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2653  ferredoxin  54.78 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2914  ferredoxin  53.39 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2983  ferredoxin  51.67 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00931519  hitchhiker  0.00068952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2800  ferredoxin  50 
 
 
106 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2553  ferredoxin  49.06 
 
 
106 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0617216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2842  ferredoxin  50 
 
 
106 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0951997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2797  ferredoxin  49.06 
 
 
106 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012664 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2492  ferredoxin  49.06 
 
 
106 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000648223  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2520  ferredoxin  48.11 
 
 
106 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2821  ferredoxin  48.11 
 
 
106 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000177659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2595  ferredoxin  47.17 
 
 
106 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000974548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1912  ferredoxin  47.17 
 
 
106 aa  97.1  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2601  ferredoxin  45.68 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2790  ferredoxin  45.68 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108419  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  29.7 
 
 
592 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  31 
 
 
561 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  27.72 
 
 
592 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  32.26 
 
 
611 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.94 
 
 
407 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  26.83 
 
 
570 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  38.82 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  31.71 
 
 
558 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  28.09 
 
 
592 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  33.75 
 
 
638 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  37.5 
 
 
652 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  26.39 
 
 
610 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.87 
 
 
431 aa  41.2  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  35.37 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  37.8 
 
 
101 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>