281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3636 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  100 
 
 
98 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  66.33 
 
 
118 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  66.67 
 
 
101 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  63.27 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  65.31 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1905  ferredoxin  61.05 
 
 
100 aa  120  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1541  ferredoxin, putative  61.86 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1257  ferredoxin  61.86 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  60.44 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0121  putative ferredoxin, 2Fe-2S  53.76 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.592235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  45.65 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0407  2Fe-2S ferredoxin  50.53 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934489  normal  0.311867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  40.43 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  40.43 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  40.43 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  38.14 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  39.18 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  38.3 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.11 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  37.11 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  36.08 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.11 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.11 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  36.08 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  36.08 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  37.11 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.08 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.02 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1955  ferredoxin, 2Fe-2S type  35.05 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.921826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1136  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.99 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  34.02 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1042  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.08 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  36.67 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0253  ferredoxin, 2Fe-2S  35.05 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3994  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.08 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38929  normal  0.0257011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.99 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1661  ferredoxin, 2Fe-2S type  35.05 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.799662  hitchhiker  0.000531904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  35.05 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  34.02 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  34.02 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  34.02 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.99 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  32.99 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  31.96 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  34.02 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.02 
 
 
111 aa  67  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2183  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.95 
 
 
112 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.04 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2285  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.05 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.99 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  35.56 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.99 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.96 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  39.76 
 
 
618 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4607  ferredoxin, 2Fe-2S type  35.05 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201113  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2147  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.56 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.442725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.96 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.99 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  30.93 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.93 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.93 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2182  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.02 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  30.93 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.96 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2574  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.36 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44606  hitchhiker  0.00922015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.93 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  35.23 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.99 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1564  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.48 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1439  (2FE-2S) ferredoxin  34.04 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101111  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  30.93 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1453  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.65 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.821654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  32.61 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1634  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.96 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246169 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  37.35 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2212  2Fe-2S ferredoxin  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1484  2Fe-2S ferredoxin  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1880  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3108  2Fe-2S ferredoxin  34.52 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.514759  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2031  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.52 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.93 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2448  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.05 
 
 
112 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230486  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>