59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2914 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2914  ferredoxin  100 
 
 		 123 aa  256  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2983  ferredoxin  89.43 
 
 		 124 aa  238  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00931519  hitchhiker  0.00068952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2653  ferredoxin  62.16 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0340  ferredoxin  53.85 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0191  ferredoxin  53.39 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000967287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2553  ferredoxin  47.22 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0617216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2797  ferredoxin  47.22 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012664 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2520  ferredoxin  47.22 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2821  ferredoxin  47.22 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000177659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2842  ferredoxin  46.3 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0951997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2595  ferredoxin  46.3 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000974548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2492  ferredoxin  45.37 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000648223  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2800  ferredoxin  45.37 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1912  ferredoxin  45.37 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2601  ferredoxin  48.24 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2790  ferredoxin  48.24 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108419  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.94 
 
 		 431 aa  49.7  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  44.07 
 
 		 561 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  29 
 
 		 592 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  35.64 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.89 
 
 		 408 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  42.5 
 
 		 586 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  34.48 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  39.02 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  39.02 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  34.26 
 
 		 615 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  30.34 
 
 		 592 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  39.44 
 
 		 638 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  37.8 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  35.37 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  30 
 
 		 614 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  32.89 
 
 		 610 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  38.89 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  37.35 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  27 
 
 		 592 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  33.72 
 
 		 553 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  26.55 
 
 		 606 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  31.65 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.41 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  35.38 
 
 		 589 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.71 
 
 		 677 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  29.49 
 
 		 652 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  34.04 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  35.16 
 
 		 611 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  35.71 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  30.26 
 
 		 356 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.38 
 
 		 407 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  30.34 
 
 		 558 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  26.03 
 
 		 570 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1661  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.04 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.799662  hitchhiker  0.000531904 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.49 
 
 		 688 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.89 
 
 		 407 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  27.78 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  31.17 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.43 
 
 		 372 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.85 
 
 		 408 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.98 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  31.82 
 
 		 650 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.08 
 
 		 410 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>