126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1879 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  100 
 
 		 162 aa  342  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  64.33 
 
 		 205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  58.82 
 
 		 236 aa  191  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  53.16 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  55.26 
 
 		 277 aa  184  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  57.25 
 
 		 198 aa  169  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  38.55 
 
 		 355 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  49.61 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  41.77 
 
 		 349 aa  128  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  41.94 
 
 		 356 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  41.29 
 
 		 355 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  38.89 
 
 		 226 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  38.61 
 
 		 360 aa  110  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  37.58 
 
 		 226 aa  110  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  41.94 
 
 		 226 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  44.07 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  35.8 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  34.18 
 
 		 222 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  36.84 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0763  ferredoxin  35.44 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  37.33 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 		 580 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  41.07 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  41.07 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  33.33 
 
 		 98 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  32.29 
 
 		 118 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  40.98 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  35.53 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  38.98 
 
 		 97 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  38.98 
 
 		 97 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  40.68 
 
 		 98 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  34.67 
 
 		 570 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  32.5 
 
 		 108 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  44.68 
 
 		 561 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 		 578 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  28.92 
 
 		 101 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  37.29 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  35.71 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  32.5 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  30.09 
 
 		 598 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  36.76 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  32.91 
 
 		 92 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  38.67 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  44.68 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  27.71 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  30.95 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  38.36 
 
 		 120 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  26.96 
 
 		 614 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 		 586 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  32.88 
 
 		 104 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  33.33 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  32.95 
 
 		 605 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  34.62 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  26.51 
 
 		 101 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  38.67 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  35.82 
 
 		 558 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  34.62 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.83 
 
 		 372 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  37.66 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  29.27 
 
 		 119 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.29 
 
 		 111 aa  44.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 113 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  23.3 
 
 		 821 aa  44.3  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  29.35 
 
 		 107 aa  44.3  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  29.49 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  26.92 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  27.85 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  28.26 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 		 574 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  37.04 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  25.93 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  25.93 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.3 
 
 		 407 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  25.93 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  28.71 
 
 		 618 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  34.72 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  28.77 
 
 		 571 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.95 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  32.91 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  25.93 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_002620  TC0329  ferredoxin  39.62 
 
 		 91 aa  42  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.378645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  30.95 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  29.76 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  29.11 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  29.49 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  40.82 
 
 		 98 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.29 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.29 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.29 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.95 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  32.1 
 
 		 107 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  34.18 
 
 		 592 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  28.24 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.95 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  25.3 
 
 		 101 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.95 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.95 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3190  2Fe-2S ferredoxin  31.58 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  29.51 
 
 		 616 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3929  ferredoxin  31.58 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>