119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1172 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  100 
 
 		 145 aa  297  4e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  65.22 
 
 		 360 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  57.97 
 
 		 355 aa  179  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  60.14 
 
 		 349 aa  179  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  56.12 
 
 		 218 aa  166  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  50 
 
 		 356 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  48.3 
 
 		 355 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  43.45 
 
 		 221 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  41.38 
 
 		 226 aa  121  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  39.72 
 
 		 226 aa  120  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  39.73 
 
 		 226 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  40.43 
 
 		 222 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  41.78 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  49.15 
 
 		 236 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  41.84 
 
 		 198 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0763  ferredoxin  45.39 
 
 		 228 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  40.12 
 
 		 205 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  44.07 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  44.66 
 
 		 277 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  37.5 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  39.36 
 
 		 578 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  41.98 
 
 		 618 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  37.08 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  47.76 
 
 		 580 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  40.28 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  40.98 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  40.98 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  38.36 
 
 		 616 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  40.98 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.41 
 
 		 431 aa  50.1  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  41.27 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.68 
 
 		 407 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.35 
 
 		 408 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 		 574 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  48 
 
 		 571 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  40.98 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  33.67 
 
 		 694 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  36.76 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  36.76 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  39.34 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  36.67 
 
 		 598 aa  48.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.91 
 
 		 407 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  46.43 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4717  ferredoxin  36.25 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  40 
 
 		 652 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  39.73 
 
 		 561 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  36 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  36.36 
 
 		 673 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.97 
 
 		 407 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.03 
 
 		 407 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  33.33 
 
 		 647 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  42.86 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  30.58 
 
 		 679 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  40.98 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  32.32 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  36.05 
 
 		 683 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  35.79 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  38.67 
 
 		 638 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  44.44 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.11 
 
 		 437 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  44.26 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  32.39 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.13 
 
 		 407 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  37.5 
 
 		 612 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  33.8 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.33 
 
 		 407 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  37.18 
 
 		 650 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  34.62 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  35.23 
 
 		 606 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  38.81 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0329  ferredoxin  44.44 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.378645  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.78 
 
 		 410 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.36 
 
 		 407 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.8 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  33.33 
 
 		 644 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  41.27 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  39.68 
 
 		 572 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  44.9 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  34.21 
 
 		 570 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  48.39 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3321  ferredoxin  36.84 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  28.41 
 
 		 821 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  43.08 
 
 		 572 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  32.94 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  33.33 
 
 		 538 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  30.68 
 
 		 92 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  28.57 
 
 		 434 aa  41.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.25 
 
 		 112 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.25 
 
 		 407 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  30.99 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  30.59 
 
 		 647 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.88 
 
 		 372 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  39.06 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  39.06 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  38.16 
 
 		 592 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.99 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  30.99 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  34.34 
 
 		 673 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>