41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0471 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
158 aa  317  5e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  79.62 
 
 
163 aa  239  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  68.07 
 
 
125 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  58.68 
 
 
120 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  50.83 
 
 
120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  50 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  50.83 
 
 
120 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  56.44 
 
 
120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  42.96 
 
 
144 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  49 
 
 
98 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  46 
 
 
98 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  46.39 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  46.39 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  42 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  43 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  42.57 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  36.75 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  37.61 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  39.08 
 
 
259 aa  61.6  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  37 
 
 
108 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  37 
 
 
108 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  37.11 
 
 
112 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  37 
 
 
112 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  34.88 
 
 
304 aa  50.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  34.12 
 
 
312 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  33.94 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  32.19 
 
 
622 aa  48.5  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  30.63 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  33 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  34.02 
 
 
349 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.91 
 
 
113 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  37.08 
 
 
357 aa  43.9  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  29.76 
 
 
356 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  40.62 
 
 
218 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  34 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  40.62 
 
 
355 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  29.91 
 
 
106 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  39.06 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  31.58 
 
 
205 aa  41.2  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  33.65 
 
 
226 aa  40.8  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  33.03 
 
 
106 aa  40.8  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>