31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3412 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  100 
 
 		 112 aa  230  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  68.52 
 
 		 108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  68.52 
 
 		 108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  63.06 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  55.88 
 
 		 104 aa  121  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  52.94 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  51.96 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  41 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  40 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  43.33 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  40 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  35.42 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  40 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  34.48 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  46.34 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  43.9 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  35.63 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  37 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  36 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  34.44 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  35.37 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  35.9 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  35.9 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  34.62 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0875  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  31.96 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  33.72 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  26.37 
 
 		 304 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0654  ferredoxin  30.23 
 
 		 124 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4909  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.37 
 
 		 459 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  29.47 
 
 		 618 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>