84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03511 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  100 
 
 
120 aa  241  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  67.23 
 
 
120 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  65.55 
 
 
120 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  66.39 
 
 
120 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  66.1 
 
 
120 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  61.34 
 
 
125 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  58.68 
 
 
158 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  59.17 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  41.18 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  51.52 
 
 
98 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  42.42 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  45.45 
 
 
98 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  47 
 
 
102 aa  87.8  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  45.36 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  45 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  45.36 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  43.43 
 
 
98 aa  84  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  43.33 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  40 
 
 
259 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  39.39 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  35.42 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  35.42 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  39.74 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  39.78 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  46.03 
 
 
349 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  34 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  32.41 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  46.03 
 
 
355 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  33.33 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  33 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  34.31 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  35.35 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  36.9 
 
 
312 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
586 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  31.73 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  34.95 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  36.67 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  33.96 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  41.27 
 
 
218 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  34.91 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  37 
 
 
355 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  33.03 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  38.37 
 
 
356 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  32.11 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  35.79 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  32.93 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  31.43 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  31.19 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  30.28 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  36 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  29.91 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  36.59 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  33.67 
 
 
622 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  33.03 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  29.21 
 
 
304 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  36.59 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  29.91 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  33.04 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  31.19 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0875  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  34.12 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  36.36 
 
 
357 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  32.35 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  29.91 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  32.38 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  31.19 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  32.35 
 
 
101 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  32.11 
 
 
106 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  31.19 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  32.58 
 
 
101 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  31.48 
 
 
106 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  31.37 
 
 
101 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  30.63 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  39.68 
 
 
356 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  31.25 
 
 
618 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  31.19 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  34.88 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  39.13 
 
 
410 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  28.97 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  32.11 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  40.74 
 
 
407 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  42.42 
 
 
277 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  34.94 
 
 
160 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  31.4 
 
 
205 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.543762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>