44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3217 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  100 
 
 
112 aa  231  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  66.67 
 
 
108 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  66.67 
 
 
108 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  63.06 
 
 
112 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  56.86 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  50.98 
 
 
123 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  48.04 
 
 
117 aa  104  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  38.1 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  37 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  41.11 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  38.04 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  38.04 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  40 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  40 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  38.04 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  33.63 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  39.78 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  35.48 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  32.58 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  36.71 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  30.53 
 
 
558 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  35.44 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  35.44 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  31.82 
 
 
304 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  34.18 
 
 
120 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56260  hypothetical protein  34.69 
 
 
308 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  31.76 
 
 
821 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  34 
 
 
259 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0875  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  33.72 
 
 
105 aa  42  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  47.27 
 
 
612 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  32.94 
 
 
605 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  31.52 
 
 
638 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  34.02 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  35.9 
 
 
612 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  31.33 
 
 
592 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  32.95 
 
 
357 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  32.53 
 
 
606 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  32.63 
 
 
618 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3263  hypothetical protein  32.65 
 
 
312 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  30.12 
 
 
592 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  41.38 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  30.23 
 
 
312 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>