114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0909 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  100 
 
 		 113 aa  229  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4717  ferredoxin  53 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3321  ferredoxin  49.04 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  37 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  39.36 
 
 		 618 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  33.33 
 
 		 652 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.33 
 
 		 353 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  34.38 
 
 		 638 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  30.84 
 
 		 236 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  35.9 
 
 		 360 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  35.23 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.98 
 
 		 353 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  33.98 
 
 		 644 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  40 
 
 		 353 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  40.28 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  37.76 
 
 		 354 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.23 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 571 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  36.17 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 553 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  38.89 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2966  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.35 
 
 		 354 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0998683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 		 578 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  37.86 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.07 
 
 		 365 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 		 558 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1898  ferredoxin  51.22 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.63 
 
 		 351 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  28.72 
 
 		 353 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  34.07 
 
 		 365 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  29.35 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.04 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  35.48 
 
 		 356 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.98 
 
 		 354 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  36.89 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  36.89 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  31.71 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.81 
 
 		 353 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.26 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  32.93 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  36.17 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.17 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  34.62 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  37.5 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.17 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.17 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.17 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.17 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.17 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.17 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  36.17 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  38.96 
 
 		 573 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.56 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.04 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.04 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.04 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.04 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  34.19 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.04 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.22 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.04 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0528  ferredoxin  35.11 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.98 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  33.68 
 
 		 572 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  34.02 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  37.5 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  31.25 
 
 		 635 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  34.07 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  34.04 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 		 363 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1799  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.75 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.18 
 
 		 354 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  31.87 
 
 		 616 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  32.32 
 
 		 547 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.18 
 
 		 354 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  34.65 
 
 		 132 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  32.5 
 
 		 137 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36 
 
 		 354 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  32.97 
 
 		 115 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1493  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.77 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  29.27 
 
 		 226 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.25 
 
 		 338 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  31.25 
 
 		 338 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  36.11 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  35.14 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.31 
 
 		 345 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  34.62 
 
 		 355 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  30.23 
 
 		 683 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  29.55 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  35.05 
 
 		 564 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.25 
 
 		 1073 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.22 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.11 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.98 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  32.05 
 
 		 355 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  30.49 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.98 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  30.3 
 
 		 650 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>