66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1580 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  100 
 
 		 360 aa  721    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  63.09 
 
 		 349 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  61.92 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  48.07 
 
 		 356 aa  336  5e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  48.49 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  49.77 
 
 		 218 aa  210  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  65.22 
 
 		 145 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  53.85 
 
 		 134 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  51.94 
 
 		 134 aa  146  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  45.28 
 
 		 221 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  39.55 
 
 		 226 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  42.01 
 
 		 226 aa  133  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  46.05 
 
 		 236 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  49.23 
 
 		 135 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  38.6 
 
 		 222 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  44.76 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  36.52 
 
 		 226 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  41.22 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  48.72 
 
 		 205 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  43.31 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  48.67 
 
 		 135 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  38.61 
 
 		 162 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  40.77 
 
 		 134 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  40.77 
 
 		 134 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  42.97 
 
 		 135 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  43.75 
 
 		 135 aa  99.4  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  42.19 
 
 		 135 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  41.54 
 
 		 135 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  40.32 
 
 		 140 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  42.19 
 
 		 152 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  43.36 
 
 		 135 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  40.62 
 
 		 135 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  39.52 
 
 		 140 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  39.06 
 
 		 135 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0763  ferredoxin  38.42 
 
 		 228 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  38.54 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.17 
 
 		 145 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.61 
 
 		 134 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  40.2 
 
 		 578 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  38.16 
 
 		 570 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  42.55 
 
 		 580 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  26.45 
 
 		 140 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  43.14 
 
 		 612 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  37.68 
 
 		 144 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  35.11 
 
 		 821 aa  49.7  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  30.58 
 
 		 147 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  35.9 
 
 		 113 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  30.4 
 
 		 141 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  38.27 
 
 		 683 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  35.87 
 
 		 638 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  38.55 
 
 		 618 aa  46.6  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  38.36 
 
 		 657 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  41.18 
 
 		 160 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  39.62 
 
 		 111 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  35.94 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  40.98 
 
 		 137 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  34.52 
 
 		 690 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  40.62 
 
 		 571 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  29.09 
 
 		 694 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  39.29 
 
 		 132 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  37.29 
 
 		 160 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  40 
 
 		 612 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  30.12 
 
 		 92 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  36.51 
 
 		 102 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  39.29 
 
 		 97 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  39.29 
 
 		 97 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>