27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0772 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  100 
 
 
134 aa  275  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  79.1 
 
 
134 aa  223  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  56.06 
 
 
355 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  51.94 
 
 
360 aa  146  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  53.91 
 
 
135 aa  140  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  49.24 
 
 
349 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  41.79 
 
 
134 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  41.79 
 
 
134 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  42.97 
 
 
135 aa  113  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  41.54 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  43.18 
 
 
135 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  41.22 
 
 
152 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  36.64 
 
 
140 aa  103  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  41.04 
 
 
355 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  40.46 
 
 
135 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  40.46 
 
 
135 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  37.4 
 
 
140 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  40.46 
 
 
135 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  40.15 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  39.69 
 
 
135 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.51 
 
 
134 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  38.17 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.16 
 
 
145 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  30.89 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  26.32 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  28.46 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  30.56 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>