25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4368 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  297  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  80.16 
 
 
141 aa  205  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  63.28 
 
 
140 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  54.81 
 
 
154 aa  159  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1785  hypothetical protein  37.69 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0273251  normal  0.172836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  34.15 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  30.89 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  36.56 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  38.71 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  34.41 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  34.69 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.63 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  34.41 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  36.56 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  30.16 
 
 
356 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  31.08 
 
 
355 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  29.75 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  29.84 
 
 
140 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  29.07 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  30.58 
 
 
360 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  32.99 
 
 
355 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  28.24 
 
 
140 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  28.8 
 
 
349 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  24.79 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  24.79 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>