30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1691 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  273  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  79.1 
 
 		 134 aa  223  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  58.02 
 
 		 355 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  53.85 
 
 		 360 aa  149  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  58.02 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  51.15 
 
 		 349 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  44.03 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  44.03 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  47.29 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  45.8 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  45.04 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  43.51 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  41.98 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  41.54 
 
 		 356 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  39.39 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  42.75 
 
 		 135 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  42.54 
 
 		 355 aa  105  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  40.15 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  41.22 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  41.98 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  50 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.09 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.84 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  34.15 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  26.98 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  30.89 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  27.78 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  42.65 
 
 		 464 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2931  hypothetical protein  38.33 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0484753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0081  hypothetical protein  26.77 
 
 		 320 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>