89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1154 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  100 
 
 		 356 aa  729    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  57.62 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  51.52 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  48.07 
 
 		 360 aa  336  5e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  47.19 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  54.21 
 
 		 218 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  50 
 
 		 145 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  42.01 
 
 		 226 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  39.39 
 
 		 222 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  43.95 
 
 		 221 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  41.18 
 
 		 226 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  40.24 
 
 		 226 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  46.05 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  42.01 
 
 		 226 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  41.56 
 
 		 277 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  40.24 
 
 		 205 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  41.94 
 
 		 162 aa  125  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  42.5 
 
 		 198 aa  124  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0763  ferredoxin  37.39 
 
 		 228 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  41.54 
 
 		 134 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  41.54 
 
 		 134 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.22 
 
 		 135 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  37.88 
 
 		 135 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  36.43 
 
 		 134 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  36.43 
 
 		 134 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  37.12 
 
 		 135 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  37.78 
 
 		 152 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  39.83 
 
 		 140 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  37.69 
 
 		 135 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  36.3 
 
 		 135 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  33.9 
 
 		 140 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  38.76 
 
 		 135 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  35.61 
 
 		 135 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  38.54 
 
 		 205 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  36.67 
 
 		 135 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  34.51 
 
 		 135 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.91 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.2 
 
 		 145 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  30.16 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  39.29 
 
 		 570 aa  56.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  32 
 
 		 821 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.44 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  32.71 
 
 		 144 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  35.48 
 
 		 119 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 		 128 aa  49.7  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  35.48 
 
 		 98 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  41.54 
 
 		 592 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.18 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  35.87 
 
 		 578 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  40.98 
 
 		 97 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  40.98 
 
 		 97 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2595  ferredoxin  35.14 
 
 		 106 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000974548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.11 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  43.08 
 
 		 137 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  30.23 
 
 		 694 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 		 580 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  37.5 
 
 		 592 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  36.17 
 
 		 98 aa  46.2  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  42.86 
 
 		 98 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  39.06 
 
 		 612 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  50 
 
 		 109 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  36.36 
 
 		 650 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  35.11 
 
 		 638 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  30.93 
 
 		 616 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  41.07 
 
 		 132 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  40.98 
 
 		 98 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  36.11 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.96 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  33.77 
 
 		 652 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  38.67 
 
 		 592 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  31.58 
 
 		 605 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  43.33 
 
 		 571 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 		 574 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.03 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  37.93 
 
 		 598 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2983  ferredoxin  31.17 
 
 		 124 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00931519  hitchhiker  0.00068952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2842  ferredoxin  33.78 
 
 		 106 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0951997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.03 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  39.06 
 
 		 160 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  39.06 
 
 		 160 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.78 
 
 		 407 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  33.33 
 
 		 538 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2553  ferredoxin  32.43 
 
 		 106 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0617216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2520  ferredoxin  32.43 
 
 		 106 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154596  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  36.05 
 
 		 618 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2797  ferredoxin  32.43 
 
 		 106 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>