64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1662 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 		 128 aa  260  4.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  92.62 
 
 		 132 aa  236  9e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  50.53 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  48.96 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  47.37 
 
 		 98 aa  100  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  47.92 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  47.92 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  44.9 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  47.92 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  44.9 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  42.98 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  45 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  37.29 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  36.75 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  41 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  40.82 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  41 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  41 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  39.51 
 
 		 304 aa  67.8  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  37.89 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  37.89 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  37 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  35.42 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  38.1 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  35.05 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  37.11 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  46.03 
 
 		 355 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  33.98 
 
 		 644 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  35.11 
 
 		 356 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  44.23 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  36.08 
 
 		 259 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  42.86 
 
 		 355 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  41.27 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  42.86 
 
 		 356 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  42.86 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  34.65 
 
 		 618 aa  48.9  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  31.82 
 
 		 357 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  35.94 
 
 		 360 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0329  ferredoxin  47.83 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.378645  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  34.62 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0654  ferredoxin  36.14 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  35.64 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  32.35 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3470  ferredoxin  40.38 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  34.19 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  32.35 
 
 		 638 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  37.5 
 
 		 226 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  35.23 
 
 		 578 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  32.98 
 
 		 571 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 		 561 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  33.67 
 
 		 652 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3321  ferredoxin  35.94 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  32.29 
 
 		 650 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  34.92 
 
 		 349 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  38.6 
 
 		 226 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 		 586 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  31.13 
 
 		 635 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  35.85 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  32.63 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  39.29 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4717  ferredoxin  35.48 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3759  ferredoxin  29.47 
 
 		 118 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  33.96 
 
 		 592 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  27.18 
 
 		 647 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>