22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47958 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  100 
 
 
312 aa  644    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  31.8 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  30.25 
 
 
357 aa  86.3  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  34.62 
 
 
97 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  34.62 
 
 
97 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  36.63 
 
 
120 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  38.27 
 
 
144 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  34.62 
 
 
98 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  38.1 
 
 
128 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  35.64 
 
 
120 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  32.94 
 
 
102 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  37.76 
 
 
132 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  33.02 
 
 
163 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  32.69 
 
 
120 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  34.65 
 
 
120 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  34.62 
 
 
98 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  35.29 
 
 
125 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  36.9 
 
 
120 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  41.67 
 
 
98 aa  49.3  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  34.12 
 
 
158 aa  49.3  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  33.33 
 
 
98 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  32.53 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>