50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22111 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  100 
 
 
125 aa  249  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  68.07 
 
 
158 aa  170  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  64.46 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  61.34 
 
 
120 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  58.82 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  58.26 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  55 
 
 
120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  57.39 
 
 
120 aa  137  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  54.46 
 
 
98 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  54.08 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  54.08 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  50.98 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  52.94 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  47.52 
 
 
98 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  50 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  42.98 
 
 
128 aa  92  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  45.71 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  51.02 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  45.56 
 
 
259 aa  67.4  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  38.1 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  41 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  39 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  39 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  36.54 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  35.29 
 
 
312 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  36 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  34 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  33.04 
 
 
622 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  33.33 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  33.01 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  30.43 
 
 
652 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  38.82 
 
 
356 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  37.5 
 
 
357 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  33.91 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  28.23 
 
 
635 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  29.41 
 
 
304 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  29.36 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  40.7 
 
 
561 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  31.07 
 
 
101 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  31.07 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  31.07 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  36.45 
 
 
355 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  27.35 
 
 
638 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  36.46 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  34.95 
 
 
586 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  33.33 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  32.98 
 
 
107 aa  40  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  33.03 
 
 
106 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  30.28 
 
 
107 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  33.03 
 
 
106 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>