42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1863 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  79.62 
 
 		 158 aa  249  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  65.55 
 
 		 125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  59.17 
 
 		 120 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  51.67 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  59.41 
 
 		 120 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  58.42 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  58.42 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  44.44 
 
 		 144 aa  111  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  46 
 
 		 98 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  48 
 
 		 98 aa  94  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  46.39 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  46.39 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  43.69 
 
 		 102 aa  91.3  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  40 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  42 
 
 		 98 aa  85.1  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  37.29 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  39.13 
 
 		 132 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  37.89 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  33.02 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  35.48 
 
 		 112 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  36 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  36 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  36 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  35.58 
 
 		 117 aa  47.4  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  32.53 
 
 		 304 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  32.71 
 
 		 101 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  32.26 
 
 		 622 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  36.36 
 
 		 357 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  40.62 
 
 		 355 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  40.62 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 572 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  29.76 
 
 		 356 aa  42.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  33 
 
 		 104 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  30 
 
 		 113 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  35.05 
 
 		 349 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  32.04 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  39.06 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  33 
 
 		 123 aa  41.2  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  29.57 
 
 		 106 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  37.5 
 
 		 356 aa  40.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>