79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_03401 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  100 
 
 
120 aa  239  7e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  97.5 
 
 
120 aa  234  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  96.67 
 
 
120 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  80 
 
 
120 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  66.1 
 
 
120 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  55 
 
 
125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  58.42 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  56.44 
 
 
158 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  48.48 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  49 
 
 
102 aa  95.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  45.45 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  48.48 
 
 
98 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  42.42 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  44.33 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  44.33 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  44.44 
 
 
98 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  41 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  41.24 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  37.36 
 
 
259 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  35.64 
 
 
312 aa  56.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  36.11 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  31.58 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  34.85 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  39.68 
 
 
355 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  41.07 
 
 
586 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  35.44 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  35.9 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  30.21 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  35.23 
 
 
357 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  30.19 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  31.91 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  35.56 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  32.18 
 
 
356 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  29.36 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  30.23 
 
 
304 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  33.72 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  33.72 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  38.67 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  32.32 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  39.68 
 
 
218 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  29.59 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  34.74 
 
 
349 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  42.86 
 
 
226 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  35.48 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  42.19 
 
 
355 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  29.75 
 
 
622 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  31.87 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  33.7 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  36.36 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  29 
 
 
635 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  29.29 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  36.36 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  29.59 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  40 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  31.53 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  29.17 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  41.79 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  34.18 
 
 
160 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  34.18 
 
 
160 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  28.44 
 
 
106 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  42.11 
 
 
561 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  35.94 
 
 
95 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  32.1 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  41.07 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.49 
 
 
410 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  39.68 
 
 
356 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  31.78 
 
 
106 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  29.9 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  28 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  26.61 
 
 
538 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  28 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  31.51 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  28 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  31.51 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  28.44 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  44.68 
 
 
558 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  28.57 
 
 
106 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  29.79 
 
 
106 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  31.87 
 
 
107 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>