84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0628 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  62.05 
 
 		 226 aa  284  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  60.27 
 
 		 226 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  58.85 
 
 		 222 aa  268  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  59.42 
 
 		 226 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0763  ferredoxin  57.82 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  40.94 
 
 		 355 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  42.01 
 
 		 356 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  41.85 
 
 		 349 aa  135  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  39.64 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  44.16 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  42.95 
 
 		 355 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  41.22 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  39.88 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  44.76 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  38.89 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  40.74 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  41.78 
 
 		 145 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  40.36 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  40.38 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  30.93 
 
 		 578 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  35.53 
 
 		 160 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  38.16 
 
 		 160 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  34.83 
 
 		 119 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  35.71 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  35.71 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  37.93 
 
 		 549 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 580 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  41.07 
 
 		 97 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  41.07 
 
 		 97 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  35.82 
 
 		 119 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  42.86 
 
 		 98 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  37.88 
 
 		 111 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  34.34 
 
 		 598 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  33.33 
 
 		 111 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  39.29 
 
 		 102 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  35.71 
 
 		 92 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  45.1 
 
 		 98 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  28.46 
 
 		 618 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  30.77 
 
 		 101 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  28.21 
 
 		 101 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  28.26 
 
 		 821 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  29.35 
 
 		 113 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  29.49 
 
 		 112 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  29.49 
 
 		 101 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  36.59 
 
 		 120 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  34.48 
 
 		 652 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  31.82 
 
 		 107 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  42.86 
 
 		 120 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  29.49 
 
 		 101 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  32.43 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  42.86 
 
 		 120 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  32.56 
 
 		 605 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4717  ferredoxin  28.57 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  30.95 
 
 		 612 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  28.46 
 
 		 586 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  28.92 
 
 		 115 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3190  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.840017 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  33.33 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  43.4 
 
 		 98 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.21 
 
 		 112 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  33.77 
 
 		 94 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.43 
 
 		 111 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  29.07 
 
 		 113 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 		 128 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  32.53 
 
 		 650 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.92 
 
 		 111 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  35.82 
 
 		 616 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  43.14 
 
 		 98 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  32.58 
 
 		 592 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  28.21 
 
 		 111 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  31.76 
 
 		 98 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  39.29 
 
 		 120 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  38.57 
 
 		 118 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 		 132 aa  42  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  30.12 
 
 		 111 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.12 
 
 		 111 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.12 
 
 		 111 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  30.12 
 
 		 111 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.12 
 
 		 111 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  30.23 
 
 		 683 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  35.44 
 
 		 108 aa  42  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.92 
 
 		 111 aa  41.6  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.33 
 
 		 112 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>