116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0269 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  100 
 
 		 94 aa  192  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0760  ferredoxin, 2Fe-2S  65.26 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3190  hypothetical protein  57.89 
 
 		 95 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.840017 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3190  2Fe-2S ferredoxin  55.79 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3929  ferredoxin  55.79 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1450  ferredoxin  57.89 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3470  ferredoxin  37.04 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  36.36 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  36.36 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  35.48 
 
 		 670 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  36.25 
 
 		 571 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  44.23 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 		 561 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  32.53 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  35.11 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  35.11 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  43.14 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  44.23 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  44.23 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  44.23 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  30.23 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  43.14 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  30.68 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  35.37 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  36.25 
 
 		 572 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  39.56 
 
 		 580 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  32.5 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  30.77 
 
 		 597 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 		 328 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4717  ferredoxin  30.3 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  34.09 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_002620  TC0329  ferredoxin  39.71 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.378645  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  38.57 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  31.46 
 
 		 368 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  32.39 
 
 		 347 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  40 
 
 		 360 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  40 
 
 		 360 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  31.82 
 
 		 330 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  33.96 
 
 		 674 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  39.22 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.67 
 
 		 702 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  39.71 
 
 		 218 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.55 
 
 		 688 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42 
 
 		 676 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3759  ferredoxin  37.29 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  33.77 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  32.91 
 
 		 586 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  34.48 
 
 		 625 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.84 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  40 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  34.43 
 
 		 361 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.4 
 
 		 669 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  35.71 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4338  oxidoreductase, iron-sulfur-binding protein  26.58 
 
 		 312 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  48.39 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  29.35 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56260  hypothetical protein  31.65 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  36.36 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  35.9 
 
 		 618 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.23 
 
 		 346 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0938  hypothetical protein  31.08 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 		 572 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.08 
 
 		 341 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  29.33 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1001  hypothetical protein  29.73 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000133962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  36.71 
 
 		 578 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4349  ferredoxin  39.29 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  32.86 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  26.37 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4030  hypothetical protein  25.93 
 
 		 312 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  28.74 
 
 		 101 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.14 
 
 		 371 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 574 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.53 
 
 		 700 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  36.54 
 
 		 319 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0899  hypothetical protein  31.08 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.21 
 
 		 677 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  36.49 
 
 		 365 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  32 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1091  ferredoxin oxidoreductase protein  29.89 
 
 		 328 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  32 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4450  hypothetical protein  31.25 
 
 		 311 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  32.86 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1528  ferredoxin  30.67 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  28.05 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  25.61 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2202  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.21 
 
 		 363 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0120685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.77 
 
 		 357 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.33 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  32.69 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.33 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32 
 
 		 322 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.33 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32 
 
 		 322 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.33 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>