80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0760 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0760  ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 		 95 aa  190  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1450  ferredoxin  64.21 
 
 		 95 aa  136  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  65.26 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3190  hypothetical protein  63.83 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.840017 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3929  ferredoxin  59.57 
 
 		 95 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3190  2Fe-2S ferredoxin  59.57 
 
 		 95 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  34.15 
 
 		 754 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  40.28 
 
 		 586 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.26 
 
 		 669 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  31.87 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  39.34 
 
 		 774 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0329  ferredoxin  36.36 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.378645  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  35.62 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  37.93 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  30.67 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  41.1 
 
 		 574 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  35.56 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  35.62 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  35.62 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  35.62 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  31.25 
 
 		 368 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  36.17 
 
 		 625 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  32.53 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3470  ferredoxin  27.71 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2129  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.14 
 
 		 996 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0052941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.78 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  37.93 
 
 		 580 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  36.26 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.07 
 
 		 341 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4547  ferredoxin  32 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  34.25 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  34.09 
 
 		 670 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  37.35 
 
 		 618 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  32 
 
 		 330 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 		 561 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  33.75 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  32.56 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  31.43 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 578 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  34.44 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1528  ferredoxin  32.95 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  34.44 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.8 
 
 		 346 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0938  hypothetical protein  34.25 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  34.25 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  34.44 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  36.26 
 
 		 612 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4410  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.51 
 
 		 376 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.52 
 
 		 688 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  35.82 
 
 		 198 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  34.78 
 
 		 99 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  34.78 
 
 		 99 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  34.62 
 
 		 674 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3447  ferredoxin  29.47 
 
 		 340 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  37.04 
 
 		 333 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.12 
 
 		 702 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  31.82 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  31.33 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1001  hypothetical protein  32.88 
 
 		 308 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000133962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1703  ferredoxin  30.95 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  40.38 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  34.43 
 
 		 344 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  34.52 
 
 		 571 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  40.32 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  34.55 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.53 
 
 		 700 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.59 
 
 		 335 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  32.26 
 
 		 360 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  32.26 
 
 		 360 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  37.25 
 
 		 319 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  34.57 
 
 		 339 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  32.5 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  32.79 
 
 		 361 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.95 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1541  ferredoxin, putative  31.71 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1257  ferredoxin  31.71 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  32.26 
 
 		 321 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  27.4 
 
 		 94 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  34.62 
 
 		 99 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>