More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2269 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  100 
 
 
360 aa  729    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  100 
 
 
360 aa  729    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  82.68 
 
 
366 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  99.6 
 
 
247 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  47.44 
 
 
360 aa  325  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  43.34 
 
 
376 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  43.54 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  43.73 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  43.73 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  44.72 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.63 
 
 
370 aa  298  8e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  42.86 
 
 
385 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  41.57 
 
 
380 aa  296  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  42.58 
 
 
381 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  44.51 
 
 
357 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.07 
 
 
372 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.74 
 
 
371 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.93 
 
 
363 aa  285  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  45.76 
 
 
760 aa  285  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.96 
 
 
366 aa  279  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  43.09 
 
 
375 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.3 
 
 
381 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.36 
 
 
367 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.85 
 
 
374 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  44.66 
 
 
363 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.22 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  39.04 
 
 
350 aa  236  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.23 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.3 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.08 
 
 
382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  35.16 
 
 
355 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.16 
 
 
355 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.89 
 
 
355 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.52 
 
 
346 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.23 
 
 
354 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  33.23 
 
 
362 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.43 
 
 
369 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  31.25 
 
 
358 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.28 
 
 
350 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  30.12 
 
 
366 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  30.87 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  29.82 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  33.57 
 
 
325 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.53 
 
 
380 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.84 
 
 
376 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.68 
 
 
387 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  35.31 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.31 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.6 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.97 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.97 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.92 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.97 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.97 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.03 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.44 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  30.82 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  31 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  31 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  30.03 
 
 
358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  31 
 
 
382 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.43 
 
 
382 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.43 
 
 
382 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  32.64 
 
 
382 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.51 
 
 
385 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.48 
 
 
388 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.23 
 
 
371 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.8 
 
 
382 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  30.39 
 
 
356 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.56 
 
 
366 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.39 
 
 
375 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.51 
 
 
361 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  29.77 
 
 
382 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  32.39 
 
 
379 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  30.72 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.51 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02772  putative Oxidoreductase  25.82 
 
 
327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684144  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  28.73 
 
 
662 aa  119  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.83 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.55 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.76 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  26.14 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  28.97 
 
 
366 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.99 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.91 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  25.85 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  29.25 
 
 
364 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.74 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.11 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.52 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.94 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  27.27 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  29.25 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.47 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  27.94 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.92 
 
 
414 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.99 
 
 
390 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  29.78 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  28.13 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  27.94 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>