More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5060 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 		 366 aa  726    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  66.76 
 
 		 363 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  65.12 
 
 		 372 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  61.71 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  59.47 
 
 		 384 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  57.1 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  48.74 
 
 		 375 aa  328  9e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  51.09 
 
 		 376 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  50.55 
 
 		 376 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  50.55 
 
 		 376 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  53.3 
 
 		 357 aa  319  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  52.85 
 
 		 760 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  51.6 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  51.68 
 
 		 363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.78 
 
 		 371 aa  305  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  49.31 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.51 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  50.7 
 
 		 368 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  48.5 
 
 		 385 aa  288  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  41.6 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  44.93 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  43.96 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  43.96 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.91 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.39 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  45.17 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.19 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  41.94 
 
 		 247 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.83 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.61 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.66 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.23 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.52 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  31.12 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.12 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  31.81 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.03 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  31.03 
 
 		 382 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.03 
 
 		 382 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.92 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.55 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.12 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.55 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.55 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.55 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  30.46 
 
 		 382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.2 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.17 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.17 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  30.72 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  32.53 
 
 		 662 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  33.06 
 
 		 355 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.06 
 
 		 355 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.29 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.78 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  35.33 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  32.29 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.44 
 
 		 375 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.95 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.96 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  29.71 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  27.7 
 
 		 605 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.5 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.94 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.19 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  27.93 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  28.47 
 
 		 605 aa  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.12 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  28.93 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.64 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  27.64 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.23 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.11 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.24 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  27.78 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.5 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.92 
 
 		 367 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  27.07 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  28.29 
 
 		 368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  30.92 
 
 		 381 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  26.78 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  26.2 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  30.07 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.56 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.35 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.35 
 
 		 368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  31.84 
 
 		 366 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.64 
 
 		 348 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.11 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.51 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  29.34 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.44 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.07 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  27.79 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  26.78 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  27.89 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.71 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.54 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.89 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  28.35 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>