More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23260 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  100 
 
 
375 aa  748    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.74 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.04 
 
 
372 aa  326  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.9 
 
 
363 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.31 
 
 
367 aa  319  6e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  47.4 
 
 
379 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  46.93 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  45.48 
 
 
380 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  44.89 
 
 
376 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.02 
 
 
384 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  45.15 
 
 
357 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  44.09 
 
 
376 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  44.09 
 
 
376 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.29 
 
 
381 aa  271  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  41.46 
 
 
366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  42.23 
 
 
360 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  42.23 
 
 
360 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  44.99 
 
 
385 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.14 
 
 
370 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.1 
 
 
374 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  43.32 
 
 
368 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  43.99 
 
 
350 aa  256  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  43.3 
 
 
381 aa  256  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.1 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  44.72 
 
 
760 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  43.49 
 
 
363 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.45 
 
 
376 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  43.43 
 
 
247 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  36.68 
 
 
355 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.68 
 
 
355 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.01 
 
 
354 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.73 
 
 
355 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.51 
 
 
382 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.24 
 
 
368 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.99 
 
 
346 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.6 
 
 
350 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  32.44 
 
 
362 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  31.79 
 
 
382 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.79 
 
 
382 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.1 
 
 
382 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.95 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  32 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  32 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.72 
 
 
382 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.1 
 
 
380 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  31.1 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  34.2 
 
 
366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  30.86 
 
 
382 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.81 
 
 
380 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.81 
 
 
381 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.81 
 
 
380 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.81 
 
 
380 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.1 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  30.72 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  34.59 
 
 
355 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.12 
 
 
322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.78 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.78 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.78 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  33.78 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.78 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  33.78 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.78 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.61 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.78 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  28.49 
 
 
351 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.05 
 
 
334 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.14 
 
 
386 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  30.99 
 
 
379 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2702  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.64 
 
 
340 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.99 
 
 
323 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.99 
 
 
323 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.64 
 
 
352 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.99 
 
 
323 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.99 
 
 
323 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.64 
 
 
340 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.53 
 
 
414 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.65 
 
 
323 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.13 
 
 
585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  29.77 
 
 
418 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  28.48 
 
 
353 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.75 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.61 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  27.44 
 
 
358 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  29.93 
 
 
662 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.25 
 
 
388 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.29 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.65 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  28.13 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.3 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.94 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.47 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.95 
 
 
322 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  29.41 
 
 
605 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.72 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.81 
 
 
376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.61 
 
 
363 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  30.54 
 
 
381 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.51 
 
 
380 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.35 
 
 
375 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>