More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5611 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  100 
 
 
355 aa  696    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  94.29 
 
 
366 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  57.14 
 
 
362 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  39.94 
 
 
358 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.54 
 
 
376 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.89 
 
 
369 aa  185  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.36 
 
 
382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.16 
 
 
354 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.54 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  36.01 
 
 
355 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.01 
 
 
355 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.56 
 
 
350 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  34.46 
 
 
368 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  35.92 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.91 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  29.82 
 
 
360 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  29.82 
 
 
360 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.95 
 
 
370 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
346 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  33.72 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  29.86 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  35.45 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  35.45 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.82 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  34.97 
 
 
376 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.28 
 
 
372 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  33.14 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  34.59 
 
 
375 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  33.99 
 
 
385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.61 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.18 
 
 
374 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  34.63 
 
 
350 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  32.75 
 
 
363 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  29.17 
 
 
605 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.99 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  32.94 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  30.77 
 
 
662 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  30.48 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  32.55 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.64 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  31.93 
 
 
616 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.03 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  28 
 
 
605 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  24.77 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.02 
 
 
380 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.46 
 
 
382 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  28.08 
 
 
382 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  32.14 
 
 
760 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.08 
 
 
382 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.32 
 
 
366 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.25 
 
 
376 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.67 
 
 
334 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.3 
 
 
361 aa  106  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.55 
 
 
380 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.87 
 
 
387 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.76 
 
 
382 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.76 
 
 
382 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  27.22 
 
 
381 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  27.22 
 
 
380 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  36.57 
 
 
393 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  26.9 
 
 
381 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  26.9 
 
 
380 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  26.9 
 
 
380 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  26.9 
 
 
380 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02772  putative Oxidoreductase  26.83 
 
 
327 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684144  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  26.81 
 
 
382 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.99 
 
 
367 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  26.63 
 
 
351 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  26.81 
 
 
382 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.44 
 
 
382 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  27.24 
 
 
606 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  31.17 
 
 
330 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  27.24 
 
 
606 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.69 
 
 
388 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  25.54 
 
 
365 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.97 
 
 
356 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  28.44 
 
 
394 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.95 
 
 
406 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  26.9 
 
 
380 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0143  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.85 
 
 
436 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.89 
 
 
341 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  27.83 
 
 
627 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.26 
 
 
347 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.04 
 
 
386 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  25.26 
 
 
325 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  30.38 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  26.67 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  25.62 
 
 
585 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.33 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.5 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.27 
 
 
682 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.85 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.37 
 
 
363 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.25 
 
 
385 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.99 
 
 
585 aa  96.3  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  25.45 
 
 
355 aa  95.9  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.93 
 
 
700 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  31.98 
 
 
243 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.68 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.44 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>