More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02772 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02772  putative Oxidoreductase  100 
 
 		 327 aa  683    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.78 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  26.24 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.11 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  28.14 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  26.55 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.12 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.92 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  25.82 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  25.82 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.24 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  32.24 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.24 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  27.94 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  27.44 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.63 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.4 
 
 		 382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  26.51 
 
 		 379 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.19 
 
 		 384 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  26.63 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  26.83 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  28.65 
 
 		 760 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  27.03 
 
 		 360 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  25.3 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.11 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  26.11 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  27.25 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.29 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.73 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  25 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  25 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.66 
 
 		 369 aa  99.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  23.8 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.33 
 
 		 366 aa  99.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  24.85 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.03 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.83 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.37 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.99 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  29.66 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  23.46 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.76 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  24.68 
 
 		 616 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  25.24 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0143  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  22.67 
 
 		 436 aa  82.8  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  26.1 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.45 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.89 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  22.74 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.45 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.45 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  24.45 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  24.85 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.02 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.89 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.89 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  25.41 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.48 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  25.88 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  25.28 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.91 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  26.39 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  26.12 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  23.9 
 
 		 581 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0185  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  27.51 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1554  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.51 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1358  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.51 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710358  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.66 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2727  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.51 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0213  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.51 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821344  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  23.05 
 
 		 605 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  25.14 
 
 		 1155 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1342  ferredoxin  25.4 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2721  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit  26.27 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  25.21 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.17 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  24.19 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.64 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.51 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  27.51 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.38 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  32.26 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  30.52 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  26.12 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32110  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer component  25.91 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  22.91 
 
 		 929 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1179  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.26 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  25.16 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  22.09 
 
 		 662 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  24.55 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  25.62 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2825  ferredoxin  25 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0703333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  25.62 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  26.19 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.22 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32140  anthranilate dioxygenase reductase  25.52 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  25 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  25.16 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1068  oxidoreductase FAD-binding subunit  22.98 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.570837  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  24.63 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>