More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03879 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  100 
 
 
358 aa  717    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  60.76 
 
 
369 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  41.69 
 
 
362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  39.94 
 
 
355 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  39.94 
 
 
366 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.44 
 
 
368 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.1 
 
 
346 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.43 
 
 
355 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  37.16 
 
 
355 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.16 
 
 
355 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.09 
 
 
376 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.95 
 
 
354 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  35.14 
 
 
360 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  32.95 
 
 
379 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.04 
 
 
382 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  33.14 
 
 
380 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  33.62 
 
 
376 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  33.62 
 
 
376 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.71 
 
 
363 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.61 
 
 
372 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  33.8 
 
 
381 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  32.86 
 
 
376 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  30.97 
 
 
360 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  30.97 
 
 
360 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  34.84 
 
 
368 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  33.9 
 
 
363 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.36 
 
 
370 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  30.34 
 
 
366 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.29 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.64 
 
 
350 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  31.09 
 
 
385 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  32.75 
 
 
357 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0143  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.67 
 
 
436 aa  139  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.02 
 
 
384 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  35.28 
 
 
760 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.29 
 
 
366 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  32 
 
 
605 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.02 
 
 
374 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.48 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  34.53 
 
 
350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.46 
 
 
605 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.34 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  33.68 
 
 
662 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02772  putative Oxidoreductase  28.45 
 
 
327 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684144  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  27.88 
 
 
351 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  27.89 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.6 
 
 
383 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  31.76 
 
 
339 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  31.76 
 
 
339 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  28.92 
 
 
616 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  31.65 
 
 
339 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.89 
 
 
329 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.13 
 
 
363 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.54 
 
 
396 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.65 
 
 
341 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.32 
 
 
323 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.45 
 
 
356 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.32 
 
 
323 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.32 
 
 
323 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.99 
 
 
323 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.68 
 
 
361 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.99 
 
 
323 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  32.65 
 
 
346 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.7 
 
 
367 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.67 
 
 
375 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  30.77 
 
 
1142 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  27.1 
 
 
365 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.33 
 
 
403 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.56 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  27.33 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  26.93 
 
 
382 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  26.97 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.56 
 
 
376 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.93 
 
 
382 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.93 
 
 
382 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.97 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.56 
 
 
380 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  30.16 
 
 
247 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.16 
 
 
380 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3447  ferredoxin  32.95 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.97 
 
 
382 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.92 
 
 
371 aa  96.3  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.44 
 
 
346 aa  96.3  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.13 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.73 
 
 
445 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.66 
 
 
585 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.77 
 
 
322 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.58 
 
 
678 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.42 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  24.15 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  29.43 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.09 
 
 
1138 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.85 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  31.23 
 
 
678 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  25.87 
 
 
382 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0508  ferredoxin  26.35 
 
 
350 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.303507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.1 
 
 
386 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.42 
 
 
322 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  26.67 
 
 
325 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  31.19 
 
 
344 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>