More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0252 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  100 
 
 
360 aa  706    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  68.75 
 
 
760 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  60.67 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  57.14 
 
 
363 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  56.2 
 
 
372 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  57.1 
 
 
366 aa  360  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  52.22 
 
 
376 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  52.22 
 
 
376 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  51.67 
 
 
376 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  52.86 
 
 
381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  52.12 
 
 
370 aa  342  9e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  50.84 
 
 
380 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  52.25 
 
 
379 aa  335  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  52.38 
 
 
368 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  52.52 
 
 
374 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.91 
 
 
371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.99 
 
 
367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  53.87 
 
 
363 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  47.73 
 
 
360 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  47.73 
 
 
360 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  48.39 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  48.75 
 
 
385 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  53.89 
 
 
350 aa  311  7.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  45.04 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  47.26 
 
 
381 aa  297  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  46.93 
 
 
375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  46.15 
 
 
247 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.9 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.93 
 
 
382 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.24 
 
 
346 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.42 
 
 
368 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.5 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  37.08 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.08 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.8 
 
 
355 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.36 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.77 
 
 
369 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  34.23 
 
 
362 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  35.14 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.73 
 
 
380 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  33.43 
 
 
381 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.43 
 
 
380 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.87 
 
 
382 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.13 
 
 
380 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.13 
 
 
381 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.13 
 
 
380 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.13 
 
 
380 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  33.14 
 
 
382 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.83 
 
 
382 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.83 
 
 
382 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  31.73 
 
 
366 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.83 
 
 
382 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  31.83 
 
 
382 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.83 
 
 
382 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.73 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.75 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  31.58 
 
 
382 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.34 
 
 
385 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  30.85 
 
 
366 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  30.85 
 
 
366 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  34.9 
 
 
366 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  31.81 
 
 
364 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  33.55 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  30.06 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.95 
 
 
390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  30.35 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.98 
 
 
383 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.95 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  31.78 
 
 
353 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  28.46 
 
 
368 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.55 
 
 
414 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  30.22 
 
 
366 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.3 
 
 
368 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.95 
 
 
386 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.58 
 
 
366 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 
375 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.3 
 
 
366 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.36 
 
 
403 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  33.72 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.65 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.1 
 
 
380 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.02 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.72 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  30.26 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.15 
 
 
365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.03 
 
 
363 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.06 
 
 
348 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  33.76 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  29.63 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.74 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  32.11 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.17 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.47 
 
 
388 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.81 
 
 
363 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  28.33 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.92 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  31.29 
 
 
351 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  27.43 
 
 
355 aa  126  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.03 
 
 
356 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.98 
 
 
387 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>