More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2219 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
363 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  88.15 
 
 
372 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  66.76 
 
 
366 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  58.4 
 
 
384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  58 
 
 
367 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  57.14 
 
 
360 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  57.71 
 
 
760 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  52.08 
 
 
376 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  52.08 
 
 
376 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  52.08 
 
 
376 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  51.79 
 
 
380 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  47.9 
 
 
375 aa  323  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  52.59 
 
 
379 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  54.08 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  52.68 
 
 
363 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  50.28 
 
 
385 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  51.99 
 
 
368 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.97 
 
 
370 aa  289  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  46.69 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  42.25 
 
 
366 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  42.93 
 
 
360 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  42.93 
 
 
360 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.36 
 
 
381 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.32 
 
 
374 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  48.02 
 
 
350 aa  259  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.21 
 
 
376 aa  222  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.72 
 
 
354 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  40.17 
 
 
355 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.17 
 
 
355 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.89 
 
 
355 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  40.96 
 
 
247 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.82 
 
 
368 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.85 
 
 
382 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.39 
 
 
346 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.28 
 
 
350 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  38.41 
 
 
362 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  35.71 
 
 
358 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  31.14 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.14 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.14 
 
 
382 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.14 
 
 
382 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  31.52 
 
 
381 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.52 
 
 
380 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.81 
 
 
380 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.74 
 
 
382 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.14 
 
 
382 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  30.86 
 
 
382 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  30.68 
 
 
382 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.79 
 
 
386 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.95 
 
 
380 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.95 
 
 
380 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.95 
 
 
380 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.95 
 
 
381 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  32.56 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.96 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.54 
 
 
375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.26 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.16 
 
 
385 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.13 
 
 
396 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.11 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.42 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  29.18 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  30.29 
 
 
356 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.6 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.88 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.31 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.45 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  33.23 
 
 
379 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  33.1 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  32.15 
 
 
662 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.42 
 
 
346 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  28.01 
 
 
373 aa  126  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  28 
 
 
376 aa  126  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  34.06 
 
 
366 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.48 
 
 
387 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  31.68 
 
 
339 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  31.68 
 
 
339 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  31.68 
 
 
339 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  30 
 
 
403 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.24 
 
 
380 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.03 
 
 
383 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  29.14 
 
 
358 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  29.06 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.41 
 
 
414 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  29.37 
 
 
418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  33.64 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.77 
 
 
329 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.37 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  29.83 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  29.83 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  29.67 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.07 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.37 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  33.56 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.97 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  27.6 
 
 
372 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  31.99 
 
 
394 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.06 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  27.73 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>