More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3979 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  100 
 
 		 353 aa  724    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  72.62 
 
 		 358 aa  537  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  63.08 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  62.14 
 
 		 355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  60.35 
 
 		 364 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  50.69 
 
 		 372 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  50.97 
 
 		 372 aa  358  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  52.16 
 
 		 362 aa  348  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  51.28 
 
 		 364 aa  348  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.72 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  46.05 
 
 		 380 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  46.39 
 
 		 381 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  45.78 
 
 		 380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  45.78 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  45.1 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  45.78 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  45.78 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  45.1 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  45.78 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  45.15 
 
 		 382 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  43.6 
 
 		 382 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  46.09 
 
 		 379 aa  308  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.42 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.05 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.07 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.49 
 
 		 382 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  43.77 
 
 		 382 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.77 
 
 		 382 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.07 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.77 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.77 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.92 
 
 		 368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  41.53 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.51 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.92 
 
 		 366 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  43.14 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  43.73 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  42.66 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.96 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.95 
 
 		 396 aa  295  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.22 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  40.3 
 
 		 418 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  44.69 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.18 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  43.94 
 
 		 379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.98 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.53 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.62 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  44.66 
 
 		 381 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.17 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.05 
 
 		 363 aa  264  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.99 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.7 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.72 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.98 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.7 
 
 		 380 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.4 
 
 		 376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  37.99 
 
 		 606 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  37.99 
 
 		 606 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.95 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.53 
 
 		 406 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.53 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.69 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.84 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.96 
 
 		 371 aa  222  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  38.39 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.65 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.38 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  35.13 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.1 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  36.72 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  33.62 
 
 		 605 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  37.25 
 
 		 605 aa  202  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  35.75 
 
 		 625 aa  196  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.88 
 
 		 669 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  34.94 
 
 		 662 aa  188  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.78 
 
 		 585 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  32.65 
 
 		 585 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.07 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  31.34 
 
 		 670 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  31.53 
 
 		 627 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.93 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  30.03 
 
 		 597 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.62 
 
 		 688 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.46 
 
 		 702 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  33.23 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  33.43 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  29.89 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.14 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.95 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  31.78 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.01 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.08 
 
 		 677 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  32.68 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  33.24 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  32.77 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  30.77 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  31.3 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  31.3 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5309  ferredoxin  33.53 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>