More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3622 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 
371 aa  757    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  60 
 
 
380 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  61 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  61 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  61 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  61.71 
 
 
379 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  58.33 
 
 
370 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  57.22 
 
 
381 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  59.6 
 
 
385 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  53.59 
 
 
368 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  47.91 
 
 
360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  49.86 
 
 
357 aa  322  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  50 
 
 
363 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  49.71 
 
 
372 aa  312  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.78 
 
 
366 aa  305  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  49.03 
 
 
760 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  47.91 
 
 
363 aa  285  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.77 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  41.46 
 
 
360 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  41.46 
 
 
360 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  42.34 
 
 
366 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.62 
 
 
384 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.69 
 
 
381 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  43.1 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.65 
 
 
374 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  43.48 
 
 
350 aa  227  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.78 
 
 
376 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  40.49 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.9 
 
 
354 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.49 
 
 
346 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  35.28 
 
 
355 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.28 
 
 
355 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.29 
 
 
355 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.93 
 
 
368 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.76 
 
 
382 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.07 
 
 
382 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.62 
 
 
350 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.07 
 
 
382 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.46 
 
 
376 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  28.49 
 
 
382 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.49 
 
 
382 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.49 
 
 
382 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.7 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  28.99 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.61 
 
 
380 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.18 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.31 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  27.91 
 
 
382 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  29.81 
 
 
355 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.11 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.18 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.05 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  28.78 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.66 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.78 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  28.36 
 
 
379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  29.95 
 
 
364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.17 
 
 
371 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  31.96 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.2 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.2 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.2 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.2 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  31.21 
 
 
662 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.81 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.75 
 
 
406 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.61 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  26.88 
 
 
386 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  30.74 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.66 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  28.91 
 
 
358 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  31.18 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  26.78 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  32.02 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.1 
 
 
403 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  29.55 
 
 
362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.85 
 
 
367 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.98 
 
 
374 aa  126  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.3 
 
 
414 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.43 
 
 
375 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.61 
 
 
366 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  28.98 
 
 
353 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  29.1 
 
 
605 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  30.16 
 
 
379 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.83 
 
 
585 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.35 
 
 
356 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  30.48 
 
 
358 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  27.78 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.93 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.16 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  31.99 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.62 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  27.32 
 
 
366 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  27.86 
 
 
418 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.01 
 
 
366 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  27.01 
 
 
366 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.61 
 
 
407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  27.79 
 
 
606 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  27.79 
 
 
606 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  27.6 
 
 
605 aa  119  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>