More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1275 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  100 
 
 
355 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  99.15 
 
 
355 aa  703    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
355 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  71.03 
 
 
354 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  70.19 
 
 
346 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  51.6 
 
 
376 aa  312  6.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.71 
 
 
350 aa  265  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.11 
 
 
382 aa  262  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.13 
 
 
368 aa  212  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.17 
 
 
363 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.06 
 
 
372 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  35.51 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  35.45 
 
 
360 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  35.45 
 
 
360 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  37.16 
 
 
358 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  37.08 
 
 
360 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  37.28 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  37.28 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  36.39 
 
 
376 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  36.84 
 
 
379 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  35.13 
 
 
381 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.28 
 
 
371 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  36.26 
 
 
380 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  36.68 
 
 
375 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  36.52 
 
 
385 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  38.35 
 
 
760 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.47 
 
 
369 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  38.15 
 
 
357 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.15 
 
 
370 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  36.23 
 
 
362 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  37.07 
 
 
363 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
381 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  36.86 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.06 
 
 
366 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.17 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  35.09 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.61 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.57 
 
 
384 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  33.33 
 
 
368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  34.5 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  36 
 
 
247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02772  putative Oxidoreductase  31.64 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.66 
 
 
383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.46 
 
 
375 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.46 
 
 
363 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.53 
 
 
375 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.37 
 
 
380 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.15 
 
 
363 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.05 
 
 
356 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  29.33 
 
 
358 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  33.33 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.94 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  32.09 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.53 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  29.61 
 
 
366 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.3 
 
 
365 aa  119  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.01 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.92 
 
 
380 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  25.28 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.84 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.6 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  30.86 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.1 
 
 
375 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  28.25 
 
 
382 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.25 
 
 
382 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  30.58 
 
 
662 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.75 
 
 
1138 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.81 
 
 
382 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.81 
 
 
382 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  28.62 
 
 
382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  28.53 
 
 
381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  29.02 
 
 
325 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.53 
 
 
380 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  31.13 
 
 
351 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  27.94 
 
 
606 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  27.42 
 
 
382 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  27.94 
 
 
606 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.92 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.98 
 
 
382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.25 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.81 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.73 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.25 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.25 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.77 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.25 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  30.28 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  28.49 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.45 
 
 
366 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.03 
 
 
605 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.65 
 
 
366 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  27.65 
 
 
366 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  27.84 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  28.69 
 
 
379 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.21 
 
 
367 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  34.35 
 
 
549 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.42 
 
 
382 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0143  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.12 
 
 
436 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.45 
 
 
366 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.53 
 
 
414 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>