More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0360 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 		 350 aa  701    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  52.22 
 
 		 382 aa  315  9e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.35 
 
 		 346 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  46 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  47.71 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.71 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.89 
 
 		 376 aa  262  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.43 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.73 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  34.63 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  36.36 
 
 		 360 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  38.12 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  35.55 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  35.55 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  35.55 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.28 
 
 		 363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  35.76 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.93 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.69 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.71 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  34.67 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  31.2 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.29 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.52 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  34.38 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  33.8 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.61 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  32.87 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  32.6 
 
 		 375 aa  152  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  36.6 
 
 		 760 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  30.45 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  30.45 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  32.56 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.62 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  32.46 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  30.66 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  30.64 
 
 		 358 aa  142  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.91 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.27 
 
 		 370 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  32.66 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  32.38 
 
 		 662 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  31.77 
 
 		 605 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  27.99 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  28.57 
 
 		 382 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  30.14 
 
 		 605 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  27.71 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.71 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.92 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.01 
 
 		 382 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.01 
 
 		 382 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  28.27 
 
 		 670 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.65 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  29.48 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  31.33 
 
 		 247 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.61 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.41 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  31.27 
 
 		 625 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  29.69 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.97 
 
 		 354 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.35 
 
 		 702 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  29.31 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  27.63 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.18 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.31 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.31 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  31.17 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  27.45 
 
 		 627 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  29.05 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  30.12 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.41 
 
 		 381 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.69 
 
 		 366 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  27.49 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.23 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.7 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.7 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.7 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.84 
 
 		 669 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  28.17 
 
 		 585 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.7 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.36 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  28.61 
 
 		 676 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.95 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  27.95 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.13 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.91 
 
 		 356 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  26.13 
 
 		 597 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.75 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  26.33 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.36 
 
 		 375 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1068  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.39 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.570837  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  26.78 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02772  putative Oxidoreductase  26.93 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684144  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.84 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.73 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.65 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.62 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.6 
 
 		 385 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  26.78 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.49 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  26.8 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>