More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4481 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 		 384 aa  767    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  59.47 
 
 		 366 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  58.4 
 
 		 363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  59.19 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  56.15 
 
 		 367 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  48.39 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  49.32 
 
 		 760 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  44.02 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  45.81 
 
 		 376 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  45.81 
 
 		 376 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  47.08 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  45.4 
 
 		 376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.25 
 
 		 370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.62 
 
 		 371 aa  262  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  42.4 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  44.26 
 
 		 380 aa  257  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.9 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  47.24 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  43.87 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  40.22 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  40.22 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.94 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  39.34 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  44.79 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  42.78 
 
 		 381 aa  233  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  42.66 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.25 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  39.92 
 
 		 247 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.67 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.71 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.91 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.57 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.95 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.19 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  34.19 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.19 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  31.46 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  31.82 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  30.65 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  32.32 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.4 
 
 		 369 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  30.2 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.2 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.25 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.29 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  32.69 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.53 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  28.25 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.53 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.25 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.91 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  29.6 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.91 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.91 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.91 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.15 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.15 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.11 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.15 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  28.25 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.15 
 
 		 323 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  29.38 
 
 		 358 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.03 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  28.49 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.47 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.57 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  27.68 
 
 		 355 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.21 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.91 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.87 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  30.87 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  28.53 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.87 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.87 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  30.87 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.87 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.87 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.69 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.54 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  30.51 
 
 		 662 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.54 
 
 		 322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.3 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.57 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.54 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.25 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  27.04 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.08 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3666  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.45 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100364  hitchhiker  0.000000384073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  28.7 
 
 		 339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  29.39 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  28.7 
 
 		 339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  29.39 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  26.85 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  27.94 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  28.7 
 
 		 339 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.02 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.77 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.77 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.99 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0228  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.18 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0180747  hitchhiker  0.0014836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>