More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2825 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2825  ferredoxin  100 
 
 		 336 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0703333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26070  vanillate demethylase subunit B  54.1 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7104  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  50.49 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1139  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3385  oxidoreductase FAD-binding region  45.77 
 
 		 329 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00882636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4141  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.04 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.482707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1367  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.93 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1906  vanillate O-demethylase oxidoreductase  46.25 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2186  putative oxydoreductase  45.32 
 
 		 326 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  40.06 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.99 
 
 		 316 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  40.77 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  39.36 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  37.78 
 
 		 788 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1342  ferredoxin  39.78 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  40.34 
 
 		 784 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  34.64 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  39.34 
 
 		 780 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.41 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  33.66 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  38.25 
 
 		 782 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  39.87 
 
 		 774 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  39.25 
 
 		 783 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  39.51 
 
 		 784 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  39.51 
 
 		 784 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  39.51 
 
 		 784 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  39.51 
 
 		 784 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  36.54 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  38.19 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.32 
 
 		 783 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  39.21 
 
 		 784 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  39.21 
 
 		 784 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  38.91 
 
 		 784 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  38.91 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  38.91 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.49 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  38.44 
 
 		 775 aa  159  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.85 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  38.38 
 
 		 794 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  34.97 
 
 		 588 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  38.13 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  35.51 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  38.27 
 
 		 788 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  36.14 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  37.05 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  34.82 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  38.16 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  38.16 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  37.86 
 
 		 321 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  37.86 
 
 		 321 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  36.88 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.19 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  35.24 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  35.24 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  35.24 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  36.79 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  37.09 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  39.73 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  34.27 
 
 		 321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  37.06 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  35.97 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  37.72 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  35.03 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  35.69 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  36.52 
 
 		 368 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  36.52 
 
 		 368 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.13 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  36.52 
 
 		 368 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  33.87 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  34.41 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.97 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  36.68 
 
 		 769 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  36.1 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.97 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  35.87 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  34.98 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  36.92 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  34.67 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  33.01 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  33.93 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  30.06 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  34.95 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  32.16 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  34.77 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  34.74 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.33 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  30.36 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  36.61 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  37.46 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  35.84 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  31.82 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.01 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  33.91 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.56 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  33.92 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  35.05 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  36.5 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  29.58 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  31.11 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  30 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>