More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2186 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2186  putative oxydoreductase  100 
 
 		 326 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4141  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  61.89 
 
 		 330 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.482707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1906  vanillate O-demethylase oxidoreductase  59.82 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1139  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  53.37 
 
 		 334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3385  oxidoreductase FAD-binding region  45.9 
 
 		 329 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00882636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1367  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.93 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7104  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.61 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2825  ferredoxin  45.32 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0703333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26070  vanillate demethylase subunit B  43.23 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  39.53 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.05 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  38.49 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  40 
 
 		 330 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  38.44 
 
 		 780 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  38.82 
 
 		 784 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  38.82 
 
 		 784 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  38.49 
 
 		 784 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  38.49 
 
 		 784 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  38.49 
 
 		 784 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  38.49 
 
 		 784 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  38.49 
 
 		 784 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.63 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  37.54 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  33.98 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  38.71 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  33.01 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.92 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  37.79 
 
 		 783 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1342  ferredoxin  35.83 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  33.22 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  36.22 
 
 		 782 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  32.89 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  34.52 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  32.89 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.8 
 
 		 783 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  32.89 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  32.89 
 
 		 321 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  32.89 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  38.87 
 
 		 784 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  32.89 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  37.71 
 
 		 775 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  35.29 
 
 		 769 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.9 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.67 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  37.86 
 
 		 788 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  35.39 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  31.89 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  31.82 
 
 		 558 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.48 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  34.45 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  36.16 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  36.16 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  35.47 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  36.36 
 
 		 794 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  35.44 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  36.03 
 
 		 788 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  35.26 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0337  ferredoxin  33.01 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.31 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  31.93 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  36.06 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  34.31 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  31.93 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  30.48 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  33.76 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  31.93 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.62 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  34.72 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  35.15 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  35.54 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  33.45 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  34.43 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  35.76 
 
 		 326 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2459  ferredoxin  38.58 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0241293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  33.92 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  34.44 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  34.82 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  35.26 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  33.33 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  31.99 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  32.23 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  30.94 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4832  ferredoxin  35.76 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000030603  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  32.88 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  32.88 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  32.54 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  35.18 
 
 		 333 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  35.18 
 
 		 333 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.29 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5381  ferredoxin  37.25 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4812  ferredoxin  35.29 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.02 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  33.01 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  34.01 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  32.36 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.97 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  33.88 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  34.6 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  33.02 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>