More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1139 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1139  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
334 aa  668    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1367  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  56.31 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4141  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  52.92 
 
 
330 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.482707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1906  vanillate O-demethylase oxidoreductase  51.99 
 
 
330 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3385  oxidoreductase FAD-binding region  48.8 
 
 
329 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00882636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2186  putative oxydoreductase  53.37 
 
 
326 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7104  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  53.25 
 
 
324 aa  299  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2825  ferredoxin  50 
 
 
336 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0703333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26070  vanillate demethylase subunit B  48.12 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.11 
 
 
325 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1342  ferredoxin  40.58 
 
 
322 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.73 
 
 
318 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  39.02 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  38.65 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.64 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  41.36 
 
 
782 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  40.34 
 
 
784 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  38.06 
 
 
319 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.34 
 
 
316 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0337  ferredoxin  36.09 
 
 
323 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  39.37 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  39.37 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  36.74 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  36.99 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.75 
 
 
783 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  38.1 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  40.49 
 
 
780 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  39.1 
 
 
784 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  39.1 
 
 
784 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  39.1 
 
 
784 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  39.1 
 
 
784 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  38.78 
 
 
784 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  38.78 
 
 
784 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  39.1 
 
 
784 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5381  ferredoxin  39.16 
 
 
321 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  38.64 
 
 
333 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  38.64 
 
 
333 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  38.21 
 
 
319 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  38.24 
 
 
783 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  37.15 
 
 
321 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  36.68 
 
 
320 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  33.68 
 
 
320 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  37.03 
 
 
328 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  35.99 
 
 
788 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  35.03 
 
 
317 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  37.32 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  37.11 
 
 
321 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  36.27 
 
 
318 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  34.17 
 
 
322 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  38.91 
 
 
324 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  36.88 
 
 
775 aa  152  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  35.23 
 
 
588 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  38.28 
 
 
788 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7253  ferredoxin  33.23 
 
 
334 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  34.86 
 
 
321 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  37.99 
 
 
327 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  40.14 
 
 
316 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  33.96 
 
 
322 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.51 
 
 
321 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  35.78 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  39.02 
 
 
774 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  34.82 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  35.71 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  35.83 
 
 
325 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.86 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  35.25 
 
 
319 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.99 
 
 
317 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  35.09 
 
 
330 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  34.53 
 
 
322 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  38.04 
 
 
318 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  36.43 
 
 
319 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  34.15 
 
 
324 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  34.8 
 
 
318 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.08 
 
 
317 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  36.33 
 
 
657 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  33.12 
 
 
326 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  33.57 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  35.95 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  35.95 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  34.91 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  37.46 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  35.07 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.75 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  33.11 
 
 
1069 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  38.7 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  37.54 
 
 
351 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  37.91 
 
 
319 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.55 
 
 
315 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  32.04 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  36.16 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1220  ferredoxin  38.98 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.399745  decreased coverage  0.00184226 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  33.97 
 
 
318 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  32.08 
 
 
321 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  35.29 
 
 
326 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.1 
 
 
316 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  37.54 
 
 
754 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  35.42 
 
 
321 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  31.76 
 
 
321 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  32.87 
 
 
319 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  33.66 
 
 
323 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>