29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3470 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3470  ferredoxin  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  37.04 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  31.96 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  35.42 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3190  2Fe-2S ferredoxin  31.58 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3929  ferredoxin  31.58 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  35.19 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1450  ferredoxin  32.58 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  35.19 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  37.04 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0760  ferredoxin, 2Fe-2S  27.71 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3190  hypothetical protein  31.58 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.840017 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  32.26 
 
 		 618 aa  44.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  40.38 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  40 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  39.34 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  33.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  30.21 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  34.62 
 
 		 102 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4900  hypothetical protein  26.32 
 
 		 309 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4030  hypothetical protein  29.17 
 
 		 312 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.75 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  37.25 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4450  hypothetical protein  28.92 
 
 		 311 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  29.49 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  30.77 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  45.1 
 
 		 662 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1528  ferredoxin  31.43 
 
 		 96 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4338  oxidoreductase, iron-sulfur-binding protein  28.12 
 
 		 312 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>