267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0258 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 
107 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  59.41 
 
 
101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  63.27 
 
 
98 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  59.8 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  62.24 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1541  ferredoxin, putative  65.69 
 
 
101 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1257  ferredoxin  65.69 
 
 
101 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1905  ferredoxin  52.48 
 
 
100 aa  104  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  52.17 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0407  2Fe-2S ferredoxin  49.5 
 
 
100 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934489  normal  0.311867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0121  putative ferredoxin, 2Fe-2S  47.12 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.592235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  44.09 
 
 
113 aa  87  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  41.24 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  39.18 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  38.14 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  38.14 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1564  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.05 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1439  (2FE-2S) ferredoxin  35.78 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101111  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  36.26 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.04 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  36.84 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  34.04 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  34.78 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2574  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.52 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44606  hitchhiker  0.00922015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  34.07 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  36.96 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.16 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  32.97 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  32.97 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.97 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.97 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  31.52 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  34.07 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.97 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  32.63 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.52 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4607  ferredoxin, 2Fe-2S type  39.13 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201113  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  36.26 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.52 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  31.76 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  31.18 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3994  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.7 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38929  normal  0.0257011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  35.87 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.97 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.97 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  34.07 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.58 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  28.42 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  29.35 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  31.87 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1136  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.26 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.16 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.18 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.26 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  30.48 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  28.26 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  32.97 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.26 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  35.48 
 
 
618 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  30.43 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0253  ferredoxin, 2Fe-2S  31.58 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1149  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.26 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796638  normal  0.0925301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.07 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.77 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2031  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.26 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2158  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.26 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271767  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.87 
 
 
112 aa  57.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1042  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.87 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  31.4 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1484  2Fe-2S ferredoxin  29.35 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  32.97 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  29.35 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.35 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  29.35 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  31.4 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.97 
 
 
112 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  29.35 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  31.58 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3108  2Fe-2S ferredoxin  29.35 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.514759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2212  2Fe-2S ferredoxin  29.35 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0847  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.78 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  30.53 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2183  ferredoxin, 2Fe-2S type  30.43 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1493  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.58 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.47 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.47 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2285  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.43 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>