233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1587 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  100 
 
 		 108 aa  217  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  63.81 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  61.86 
 
 		 101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  59.38 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1905  ferredoxin  55.79 
 
 		 100 aa  113  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  55.67 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  51.55 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  52.17 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1541  ferredoxin, putative  47.92 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1257  ferredoxin  47.92 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0121  putative ferredoxin, 2Fe-2S  50 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.592235 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  39.36 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  39.36 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  38.3 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0407  2Fe-2S ferredoxin  41.67 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934489  normal  0.311867 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  36.46 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  36.17 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  37.93 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1136  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  36.78 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.04 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.08 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  34.48 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1042  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.56 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.29 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1661  ferredoxin, 2Fe-2S type  33.33 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.799662  hitchhiker  0.000531904 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.29 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  34.48 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  32.29 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.48 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1564  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  35.63 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1439  (2FE-2S) ferredoxin  35.96 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101111  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  34.48 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3994  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38929  normal  0.0257011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4607  ferredoxin, 2Fe-2S type  36.78 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2183  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.48 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2285  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  35.96 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  33.33 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  43.37 
 
 		 618 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0253  ferredoxin, 2Fe-2S  34.48 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  35.63 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.63 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1955  ferredoxin, 2Fe-2S type  32 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.921826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2147  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.442725  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.63 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.63 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4331  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.850954  decreased coverage  0.0000000000132969 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  33.33 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1634  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.21 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.46 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  34.48 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  40.26 
 
 		 564 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  34.48 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2182  ferredoxin, 2Fe-2S type  31.03 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  30.69 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  35.63 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  29.47 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  30.85 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.85 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.85 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.85 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  38.2 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.85 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  30.85 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.85 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.85 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.18 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0847  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0877  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.316762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.18 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.72 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  28.72 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.72 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  28.72 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.72 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.72 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.18 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  29.89 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.79 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  29.07 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.18 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  31.46 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.18 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  31.46 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  35.14 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  32.18 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2448  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  38.03 
 
 		 561 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  35.29 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.03 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  31.46 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  31.76 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  26.6 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>