74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0698 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  100 
 
 
144 aa  296  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  70.41 
 
 
98 aa  159  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  67.33 
 
 
102 aa  155  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  69.39 
 
 
98 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  70.83 
 
 
97 aa  153  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  70.83 
 
 
97 aa  153  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  68.37 
 
 
98 aa  146  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  65.31 
 
 
98 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  44.62 
 
 
163 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  42.96 
 
 
158 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  48.48 
 
 
120 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  50.98 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  48.48 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  48.48 
 
 
120 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  44.9 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  41.18 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  43.43 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  45.92 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  37.78 
 
 
304 aa  65.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  37.5 
 
 
259 aa  63.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  38.27 
 
 
312 aa  57  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  34.48 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  39.6 
 
 
618 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  33.63 
 
 
112 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  45.45 
 
 
586 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  37.5 
 
 
205 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  35.05 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  35.05 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  32.71 
 
 
356 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 
578 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  38.96 
 
 
580 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3470  ferredoxin  31.96 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  37.68 
 
 
360 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  49.18 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  36.96 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  51.06 
 
 
561 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  43.14 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  40.85 
 
 
355 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  39.39 
 
 
349 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  33.64 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  36 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  33.64 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  33.64 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  37.11 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_002620  TC0329  ferredoxin  47.17 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.378645  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  34.41 
 
 
218 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  34.69 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  33.33 
 
 
356 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  39.71 
 
 
612 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  34.74 
 
 
572 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  35.44 
 
 
647 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  39.29 
 
 
571 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1450  ferredoxin  33.33 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  39.34 
 
 
355 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  31.18 
 
 
221 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  38.67 
 
 
558 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  30.77 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  32.89 
 
 
547 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  33.33 
 
 
226 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  45 
 
 
612 aa  42  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  34.69 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  32.63 
 
 
572 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  29.79 
 
 
236 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  36.05 
 
 
104 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3190  2Fe-2S ferredoxin  46.3 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3929  ferredoxin  46.3 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  34.15 
 
 
160 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  34.15 
 
 
160 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  31.87 
 
 
650 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  34.29 
 
 
616 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  32.65 
 
 
622 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  37.25 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  36.67 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  34.02 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>