More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4418 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 547 aa  1091    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  56.99 
 
 		 553 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  40.79 
 
 		 558 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  40.66 
 
 		 572 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  38.52 
 
 		 577 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  38.17 
 
 		 571 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  39.74 
 
 		 564 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  40.26 
 
 		 574 aa  340  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  38.43 
 
 		 589 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  40.48 
 
 		 572 aa  330  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  41.61 
 
 		 575 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.05 
 
 		 575 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  41.06 
 
 		 575 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  38.9 
 
 		 592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  38.69 
 
 		 592 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  37.79 
 
 		 580 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  36.76 
 
 		 589 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 		 561 aa  279  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  38.08 
 
 		 578 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1968  adenylate/guanylate cyclase  29.88 
 
 		 555 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4494  hypothetical protein  38.26 
 
 		 293 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.88 
 
 		 696 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 		 607 aa  97.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.62 
 
 		 1020 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.08 
 
 		 737 aa  94.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 		 488 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 		 641 aa  93.6  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 		 645 aa  93.2  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 		 437 aa  93.2  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  36.65 
 
 		 469 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  28.04 
 
 		 670 aa  89.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 		 858 aa  89.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.42 
 
 		 614 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.78 
 
 		 879 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.57 
 
 		 701 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  35.33 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  35.33 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  35.33 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  28.02 
 
 		 701 aa  88.2  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  25.11 
 
 		 794 aa  87.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  34.16 
 
 		 971 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.92 
 
 		 701 aa  87  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35 
 
 		 500 aa  87.4  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.02 
 
 		 524 aa  87  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 		 861 aa  86.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 		 759 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.26 
 
 		 764 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 		 488 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 		 756 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  35.16 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.41 
 
 		 753 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  26.37 
 
 		 734 aa  85.1  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 		 817 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  38.27 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  37.67 
 
 		 635 aa  84  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 		 752 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.65 
 
 		 585 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  34.07 
 
 		 549 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  25.82 
 
 		 911 aa  83.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  25.82 
 
 		 860 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  28.27 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  28.27 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 		 859 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  25.82 
 
 		 903 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.53 
 
 		 797 aa  82.8  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.14 
 
 		 611 aa  82  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  33.54 
 
 		 969 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  29.73 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 		 746 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 		 701 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 		 741 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  30.22 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.32 
 
 		 735 aa  80.1  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.65 
 
 		 703 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2195  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 		 255 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  25.1 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  25.1 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  25.97 
 
 		 740 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 760 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 		 758 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  30.63 
 
 		 667 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.22 
 
 		 723 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 		 675 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 		 724 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  26.37 
 
 		 717 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.89 
 
 		 643 aa  78.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  30.98 
 
 		 822 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 		 643 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  33.71 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  29.01 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>