22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4494 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4494  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0811  hypothetical protein  76.92 
 
 		 187 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  41.8 
 
 		 571 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  34.8 
 
 		 572 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  40.11 
 
 		 558 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  45.65 
 
 		 553 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  40.43 
 
 		 574 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  33.2 
 
 		 577 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  41.76 
 
 		 572 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 		 564 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 		 589 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  38.6 
 
 		 575 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.79 
 
 		 575 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  39.78 
 
 		 580 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  37.55 
 
 		 575 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  37.45 
 
 		 547 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 		 592 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  30.11 
 
 		 592 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 		 586 aa  89.7  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  39.15 
 
 		 578 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  31.13 
 
 		 589 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  31.9 
 
 		 561 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>