22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0811 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0811  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4494  hypothetical protein  77.35 
 
 		 293 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  35.25 
 
 		 571 aa  77.8  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 572 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  31.52 
 
 		 577 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  33.9 
 
 		 558 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  41.23 
 
 		 553 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 		 589 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 		 574 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  33.68 
 
 		 564 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  34.13 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 		 561 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  36.89 
 
 		 589 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  36.23 
 
 		 572 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  34.04 
 
 		 575 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  35.2 
 
 		 580 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 575 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.62 
 
 		 575 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  35.56 
 
 		 586 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 		 578 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  28.1 
 
 		 592 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  26.67 
 
 		 592 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>