145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1968 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1968  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 555 aa  1071    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  36.91 
 
 		 580 aa  293  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  39.17 
 
 		 578 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  33.01 
 
 		 571 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  33.8 
 
 		 558 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  32.68 
 
 		 586 aa  217  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  31.41 
 
 		 564 aa  217  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 		 572 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 		 574 aa  211  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  28.62 
 
 		 561 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  28.41 
 
 		 577 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  28.39 
 
 		 589 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.19 
 
 		 575 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  28.38 
 
 		 589 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  32.19 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  31.79 
 
 		 575 aa  177  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  30.62 
 
 		 553 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  31.71 
 
 		 572 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 		 592 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  29.43 
 
 		 592 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 		 547 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  22.32 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  22.02 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.19 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  24.84 
 
 		 638 aa  63.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.48 
 
 		 584 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 		 861 aa  62  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  32.62 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.88 
 
 		 1172 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  27.86 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  31.33 
 
 		 670 aa  58.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  30.66 
 
 		 971 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  23.46 
 
 		 860 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  26.54 
 
 		 483 aa  57  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  31.52 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  26.45 
 
 		 407 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 		 532 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.83 
 
 		 643 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.22 
 
 		 607 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  30.91 
 
 		 405 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  22.22 
 
 		 797 aa  55.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 		 469 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 		 632 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.67 
 
 		 696 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.81 
 
 		 758 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  25.62 
 
 		 1020 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  29.81 
 
 		 546 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11351  adenylate cyclase  29.17 
 
 		 567 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.959564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  29.29 
 
 		 404 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  28.96 
 
 		 675 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  23.87 
 
 		 643 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  22.73 
 
 		 911 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 		 536 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 		 464 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  30.92 
 
 		 536 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  30.28 
 
 		 729 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  25.22 
 
 		 614 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  29.93 
 
 		 969 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  32.21 
 
 		 1134 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.74 
 
 		 440 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  23.21 
 
 		 903 aa  51.6  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  29.25 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4494  hypothetical protein  29.3 
 
 		 293 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  24.32 
 
 		 859 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 		 1156 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  27.21 
 
 		 431 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.28 
 
 		 650 aa  50.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  22.6 
 
 		 1207 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11345  adenylate cyclase  29.67 
 
 		 541 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  30.51 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  26.11 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  25.93 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  20.36 
 
 		 641 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.15 
 
 		 1089 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  27.33 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  26.72 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.97 
 
 		 723 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  29.91 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.98 
 
 		 757 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  25.33 
 
 		 864 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  38.27 
 
 		 612 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  25.13 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.4 
 
 		 678 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  27.85 
 
 		 549 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  21.14 
 
 		 936 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 		 591 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  25.15 
 
 		 667 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  41.1 
 
 		 618 aa  47.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 		 515 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  22.11 
 
 		 358 aa  48.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3760  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.31 
 
 		 522 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>