96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0877 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  100 
 
 		 236 aa  486  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  58.56 
 
 		 221 aa  271  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  65.52 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  55.5 
 
 		 198 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  59.62 
 
 		 277 aa  217  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  56.52 
 
 		 162 aa  192  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  48.45 
 
 		 349 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  44.87 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  45.06 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  36.2 
 
 		 355 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  45.91 
 
 		 360 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  42.77 
 
 		 355 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  42.94 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  41.46 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  35.98 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  43.59 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  49.15 
 
 		 145 aa  112  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  39.61 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  33.14 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0763  ferredoxin  41.83 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  31.82 
 
 		 821 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  38.67 
 
 		 137 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  33.33 
 
 		 160 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  35.05 
 
 		 570 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  31.43 
 
 		 598 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  32.23 
 
 		 652 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.73 
 
 		 407 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.17 
 
 		 407 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  30.84 
 
 		 113 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.33 
 
 		 407 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  38.2 
 
 		 98 aa  48.9  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  27.69 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  30.85 
 
 		 578 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  35.63 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  36.11 
 
 		 111 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  35.63 
 
 		 160 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  32.32 
 
 		 113 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.32 
 
 		 408 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  36.11 
 
 		 618 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  35.37 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  32.04 
 
 		 118 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.17 
 
 		 407 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31 
 
 		 127 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  34.69 
 
 		 580 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  28.75 
 
 		 104 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  29.21 
 
 		 574 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.43 
 
 		 412 aa  45.1  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.33 
 
 		 407 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  34.72 
 
 		 571 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  32.52 
 
 		 614 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  36.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  34.72 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.11 
 
 		 111 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  34.57 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  27.27 
 
 		 434 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.72 
 
 		 112 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.5 
 
 		 407 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  35.29 
 
 		 605 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  33.68 
 
 		 647 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.95 
 
 		 407 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 872 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.46 
 
 		 407 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.72 
 
 		 111 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.72 
 
 		 112 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  32.29 
 
 		 586 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.72 
 
 		 112 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.72 
 
 		 112 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.72 
 
 		 112 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  35.14 
 
 		 112 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1450  ferredoxin  40.3 
 
 		 95 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 112 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  37.88 
 
 		 561 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  36.14 
 
 		 102 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  30.63 
 
 		 635 aa  42  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  38.81 
 
 		 109 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  36.36 
 
 		 94 aa  42.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2653  ferredoxin  33.33 
 
 		 124 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.72 
 
 		 111 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  26.55 
 
 		 411 aa  42.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.72 
 
 		 111 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.72 
 
 		 111 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  34.72 
 
 		 111 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.72 
 
 		 111 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  34.72 
 
 		 111 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  33.75 
 
 		 97 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.72 
 
 		 111 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  33.75 
 
 		 97 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2595  ferredoxin  30 
 
 		 106 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000974548  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  39.71 
 
 		 357 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>