82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2653 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2653  ferredoxin  100 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2914  ferredoxin  62.16 
 
 
123 aa  140  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2983  ferredoxin  58.56 
 
 
124 aa  136  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00931519  hitchhiker  0.00068952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0191  ferredoxin  54.78 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000967287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0340  ferredoxin  52.63 
 
 
117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2800  ferredoxin  43.4 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2553  ferredoxin  43.4 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0617216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2492  ferredoxin  41.51 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000648223  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2520  ferredoxin  43.4 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2821  ferredoxin  43.4 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000177659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2797  ferredoxin  43.4 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012664 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2842  ferredoxin  43.4 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0951997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1912  ferredoxin  42.45 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2595  ferredoxin  39.62 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000974548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2601  ferredoxin  43.53 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2790  ferredoxin  43.53 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  41.33 
 
 
561 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.56 
 
 
408 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  31.58 
 
 
606 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  40.22 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.47 
 
 
407 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  36.36 
 
 
635 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  33.73 
 
 
627 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.48 
 
 
407 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  38.55 
 
 
101 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  35.09 
 
 
615 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  34.94 
 
 
638 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  35 
 
 
616 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  34.18 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.41 
 
 
431 aa  45.4  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  36.9 
 
 
343 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  32.53 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  34.74 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.41 
 
 
412 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  34.74 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  34.74 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.47 
 
 
411 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.77 
 
 
331 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  33.66 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.56 
 
 
407 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 
592 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1905  ferredoxin  36.84 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.96 
 
 
410 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  32.53 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1001  hypothetical protein  35.23 
 
 
308 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000133962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.27 
 
 
411 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.53 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.56 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0899  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.08 
 
 
112 aa  42  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  29.07 
 
 
356 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.63 
 
 
407 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4900  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4030  hypothetical protein  31.03 
 
 
312 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.95 
 
 
407 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.63 
 
 
407 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56260  hypothetical protein  36.05 
 
 
308 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.73 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  33.33 
 
 
236 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  34.83 
 
 
112 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0938  hypothetical protein  32.98 
 
 
306 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  33.75 
 
 
558 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  36.17 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1661  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.65 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.799662  hitchhiker  0.000531904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  34.18 
 
 
650 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  32.89 
 
 
221 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4338  oxidoreductase, iron-sulfur-binding protein  31.03 
 
 
312 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  28.92 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.99 
 
 
346 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  31.46 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  35.8 
 
 
558 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  36.59 
 
 
553 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  33.33 
 
 
618 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.12 
 
 
408 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4450  hypothetical protein  29.07 
 
 
311 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  30 
 
 
98 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.27 
 
 
365 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 
589 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  30.38 
 
 
614 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  38.57 
 
 
586 aa  40  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  26.09 
 
 
407 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.44 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>