101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1912 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1912  ferredoxin  100 
 
 
106 aa  216  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2595  ferredoxin  87.74 
 
 
106 aa  191  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000974548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2821  ferredoxin  83.02 
 
 
106 aa  190  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000177659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2520  ferredoxin  83.02 
 
 
106 aa  190  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2842  ferredoxin  82.08 
 
 
106 aa  190  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0951997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2553  ferredoxin  82.08 
 
 
106 aa  189  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0617216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2797  ferredoxin  82.08 
 
 
106 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2800  ferredoxin  80.19 
 
 
106 aa  186  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2492  ferredoxin  79.25 
 
 
106 aa  185  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000648223  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2601  ferredoxin  81.18 
 
 
88 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2790  ferredoxin  81.18 
 
 
88 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0340  ferredoxin  47.66 
 
 
117 aa  97.1  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0191  ferredoxin  47.17 
 
 
122 aa  97.1  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000967287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2983  ferredoxin  46.3 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00931519  hitchhiker  0.00068952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2914  ferredoxin  45.37 
 
 
123 aa  90.1  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2653  ferredoxin  42.45 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  36.08 
 
 
561 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  33 
 
 
589 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  37.76 
 
 
577 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
558 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
592 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 
578 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  34.78 
 
 
589 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  31.58 
 
 
592 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  32.53 
 
 
553 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.25 
 
 
365 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  39.06 
 
 
586 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.25 
 
 
407 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.25 
 
 
372 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.4 
 
 
575 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
574 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 
575 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  32.88 
 
 
570 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 
575 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 
572 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.47 
 
 
431 aa  52  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 
564 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  35.63 
 
 
638 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  36.9 
 
 
571 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  36.56 
 
 
101 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  33.73 
 
 
572 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  29.76 
 
 
592 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  28.57 
 
 
592 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  30 
 
 
369 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 
580 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.62 
 
 
411 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.62 
 
 
411 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 
547 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  31.4 
 
 
434 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  33.71 
 
 
618 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  31.94 
 
 
592 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.62 
 
 
412 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  34.88 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.59 
 
 
437 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  34.83 
 
 
606 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.76 
 
 
407 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  31.87 
 
 
598 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.76 
 
 
407 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.33 
 
 
410 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  35.21 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  34.72 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  28.85 
 
 
821 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  30.26 
 
 
610 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.5 
 
 
407 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  27.63 
 
 
614 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  34.62 
 
 
644 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  34.07 
 
 
652 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  34.41 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.14 
 
 
407 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.58 
 
 
408 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  33.33 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.26 
 
 
407 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  32.38 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4030  hypothetical protein  30 
 
 
312 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.76 
 
 
407 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  37.5 
 
 
612 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  31.11 
 
 
205 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  33.33 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.35 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.06 
 
 
322 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  31.33 
 
 
683 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  35.14 
 
 
356 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  30.77 
 
 
605 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.25 
 
 
407 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4338  oxidoreductase, iron-sulfur-binding protein  32.18 
 
 
312 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  38.3 
 
 
612 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  37.35 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.95 
 
 
346 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.73 
 
 
102 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  31.03 
 
 
611 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.94 
 
 
408 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.84 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  34.34 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.14 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  37.8 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4450  hypothetical protein  29.89 
 
 
311 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.78 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1149  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.91 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796638  normal  0.0925301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  36.9 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1136  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.41 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>